计算机辅助药物设计的Linux基础（三）
1、文件属性修改的命令
（1）chgrp命令 改变文件所属用户组。如：
[root@puma ~]# chgrp –R mdkj install.log（将主文件夹内的install.log文件的用户组改为mdkj，该命令要以root身份执行。-R：进行递归（recursive），表示连同其子目录下的所有文件、目录均更新为这个用户组。）
（2）chown命令 改变文件所有者。如：
[root@puma ~]# chown –R mdkj install.log（将主文件夹内的install.log文件的所有者改为mdkj。）
（3）chmod命令 改变文件的权限。Linux系统中，可用数字代表各个权限：r=4，w=2，x=1。每种身份各自的三个权限分数通过累加表示，因此，权限rwx=4+2+1=7， 权限r-x=4+1=5。其他权限以此类推。如：
[mdkj@puma ~]$ chmod 755 *sh（将当前目录下后缀名为.sh的所有文件的权限修改为所有者可读、可写、可执行，同用户组成员与非本用户组其他用户可读、可执行。）
2、文件显示的命令
（1）cat命令 由第一行开始显示文件内容。cat命令有6个可用参数：-A可列出非空白的特殊字符；-b可列出行号，空白行不标号；-E显示结尾的断行字符$；-n连同空白行打印出行号；-T将Tab按键以^T形式显示出来；-v可列出一些看不出的特殊字符。如：
[mdkj@puma md]$ cat leap.in（在屏幕上显示文件leap.in的内容。）
（2）tac命令 从最后一行开始显示文件内容。如：
[mdkj@puma md]$ tac leap.in（在屏幕上反向列示文件leap.in的内容。）
（3）nl命令 显示的时候输出行号。nl命令有3种参数：-b，-n和-w。每种参数又有各自的参数设置。具体示例如下：
[mdkj@puma md]$ nl –b a –n rz –w 3 leap.in（显示leap.in的内容，并连同空白输出行号，行号前自动补3个0。）
（4）more命令 一页一页地显示内容。在more命令运行中，按Space键代表向下翻一页；在查看文件时，按b代表往回翻页；按Enter键代表向下滚一行；按“/”后输入字符串代表在当前显示的内容中向下查找输入的字符串；输入“:f”立刻显示出文件名以及目前显示的行数；按q代表离开more模式，不再显示文件内容。具体示例如下：
[mdkj@puma md]$ more leap.log（一页一页地显示文件leap.log的内容。）
（5）less命令 与more命令类似，但可以使用PageUp和PageDown前后翻页。还可输入“?+字符串”向上查询输入的字符串；按n重复前一个“/或?”的查询；按N反向重复前一个“/或?”的查询。例如：
[mdkj@puma md]$ less leap.log（一页一页地显示文件leap.log的内容。）
（6）head命令 查阅指定文件的前面几行。具体的行数由参数-n number控制，例如：
[mdkj@puma md]$ head –n 5 leap.in（显示文件leap.in中的前5行内容。）
（7）tail命令 查阅指定文件的末尾几行。使用方法与head命令类似，如：
[mdkj@puma md]$ tail –n 5 leap.in（显示文件leap.in中的后5行内容。）
（8）touch命令 修改文件时间或创建新文件。touch命令有5个可选参数：-a表示仅修改访问时间；-c表示仅修改文件的时间，若该文件不存在则不创建新文件；-d后面接欲修改的日期而不用当前日期；-m表示修改文件的mtime；-t后面接欲修改的时间而不用当前时间，格式为[YYMMDDhhmm]。具体示例如下：
[mdkj@puma md]$ touch test（在当前目录下创建一个名为test的空文件。）
3、选取与排序的命令
（1）grep命令 在文件中查找指定字符串，并将含有指定字符串的行显示出来。此命令有6个可选参数：-a表示将二进制文件以文本文件的方式进行数据查找；-c表示计算找到指定字符串的次数；-i表示查找字符串时忽略字母大小写差异；-n表示输出时，将行号一并输出；-v表示反向选择，显示不含指定字符串的行；–color=auto表示将找到的字符串部分加上颜色显示。示例如下：
[mdkj@puma md]$ grep –n –color=auto ‘prmtop’ leap.in（在leap.in文件中选取含有关键字prmtop的行，连同行号显示，且用不同的颜色标示prmtop。）
（2）sort命令 对文本中的各行进行排序。此命令有8个参数可选：-f表示忽略大小写差异；-b表示忽略最前面的空格；-M表示以月份的名字排序；-n表示使用纯数字排序；-r表示反向排序；-u表示相同的数据中，仅出现一行作为代表；-t表示分隔符；-k表示以区间进行排序。例如：
[mdkj@puma md]$ sort leap.in（以默认的第一个数据对leap.in中的各行排序。）
（3）uniq命令 在完成排序的文件中去除重复的行。uniq命令有两个参数：-i表示忽略大小写字符的不同；-c表示进行计数。例如：
[mdkj@puma md]$ sort leap.in | uniq –c（以默认的第一个数据对leap.in中的各行排序，排序完成后，将重复的数据仅以一行显示，并标出重复的次数。）
（4）wc命令 统计文件中的行数、字数及字符数，并将统计结果显示出来。此命令有3个可选参数：-l表示列出行；-w表示列出字（英文单字）；-m表示列出字符。例如：
[mdkj@puma md]$ cat leap.in | wc（统计文件leap.in中的行数、字数和字符数。）
