魔德科技案例：分子对接研究水生动物被鳗弧菌感染的作用机制

本文采用实验方法确定了鞭毛蛋白flaB对于诱导细胞凋亡和炎症反应的能力最强。在体外实验中，通过PAGE，酵母双杂交和荧光分析，证明flaB和TLR5之间存在较强的相互作用。通过分子对接方法研究了二者的相互作用模式，并根据相互作用的氨基酸信息，采用SPR技术对13个氨基酸进行突变，最后验证其中9个氨基酸对于flaB和TLR5的分子识别具有重要的作用。

魔德科技案例：量子化学计算解决富勒烯水溶性难题

本文合成了含6个葡萄糖的糖功能化水溶性三苯并三醌衍生物TBTQ-(OG)6，并利用荧光光谱和紫外可见光谱研究了其在共有机溶剂和水溶液中与C60和C70富勒烯的相互作用。研究结果表明，将富勒烯包合到水溶性的TBTQ-(OG)6宿主中，极大地补偿了它们的疏水性，并形成了自组装微球，这可能具有一定的生物和制药应用潜力。

魔德科技案例：分子动力学模拟辅助建立血浆中痕量农药的检测方法

采用分子动力学模拟(Molecular dynamics, MD)方法研究了ppy纳米线与拟除虫菊酯的吸附机理。考察并优化了提取条件，包括洗脱液类型、洗脱液用量、提取时间和ppy纳米线用量。由于对聚吡咯结构与6种不同菊酯类化合物的吸附情况以及吸附过程尚不清楚，经与魔德科技（www.modekeji.cn）技术团队沟通，采用分子动力学模拟（Molecular Dynamics, MD）来研究聚吡咯对菊酯类化合物的吸附情况。

魔德科技案例：基于药物偶联策略的纳米组装体用于药物递送

本文通过MD模拟和量子化学计算研究了共组装机制和构效关系，以证明假设，即SMA可以将疏水药物转化为纳米组装体。这一假设在十多种SMA中进行了探讨，并用五种化疗药物进行了测试：索拉非尼(SF)、10-羟基喜树碱(HCPT)、多西他赛(DTX)、伊鲁替尼(IBR)和拉帕替尼(LAP)。在分子水平上对它们的结构、动力学性质和组装机制进行了探索。