AutoDock 力场参数

在AutoDock 4中，新加了一个命令“parameter_file”,此命令可以更改各种力场参数，如范德华力、氢键等，也可更改原子溶解参数、线性自由能模型中的线性回归系数等。

AutoDock 4标准参数保存于“AD4.parameters.dat”文件中，该文件位于AutoDock 4 根目录下形如“autodocksuite-4.n.m/src/autodock-4.x.y”的目录中。形式如下：

上图中为AutoDock的默认参数,注意，不更改参数时，AutoDock将以默认的参数运行。